离开了关东神奇宝贝学院后，他们的下一个目的地最终被定为了枯叶市。
主要是为了满足小霞和小黄的看大海的愿望，嗯……顺带满足小刚去看大海边美女的愿望。
带着他们共同的目标，大家愉快的踏上旅行。
然而，不出意外的话，意外又发生了。
尽管这次没有智爷这个重度路痴带路，是在小刚一个职责担当的带领下，他们也找不准精确的路线。
毫无疑问又迷路了！
“我的沙滩，我的水系神奇宝贝们，全没了…”小霞瘫倒在地，她的美梦破灭了。
她的目标可是拥有大海的枯叶市啊，而不是因为迷路在这里翻山越岭。
“小霞姐姐……”还是小女孩的小黄安慰着队伍里的大姐姐。
以小霞的脾气，原本是想向拥有地图的小刚抱怨，但一想到旁边还有一个小黄，自己身为姐姐可要表现出一个好榜样。
于是乎，将原本的脾气硬生生给压了回去。
看着几人的表现，他有些不好意思的挠头挠头。
在他们需要自己用波导之力探路的时候，被自己与身体不适的缘故拒绝了，不然众人怎么可能会迷路。
而这一切都是为了原着中的妙蛙种子，他命中注定的妙蛙种子。
为了这一切，他只能由小刚带队，尽量远离官方开辟的道路，寻找位置偏僻的神奇宝贝乡。
“吗那~”
“快看，那里有一只走路草哎！”突然，在小智一行人的前方出现了一只走路草。
娇小的走路草，晃晃悠悠的从草丛当中钻出来，呆萌可爱的样子一下子抓住了两个女孩的眼球。
引来了小霞的一惊一乍。
‘终于找到了’
功夫不负有心人的小智终于等到了他想要见到的神奇宝贝——走路草。
因为他知道，只要跟着走路草，就大概率能够地找到妙蛙种子。
花费了那么长的时间，自己总算来到了的目的地——神奇宝贝乡。
“好可爱，我要收服它！”
被走路草可爱外表迷惑的小霞，抛出自己的精灵球。
走路草自然不是小智的菜，不过他能够为自己引来妙蛙种子。
而且走路草可是会进化成臭臭花，就颜值方面，这可不是很能打。
“宝石海星，使出水枪。”
胆小的走路草想要往身后逃跑，但宝石海星恰好挡在了想要逃跑的走路草的方向，然后就是一发水枪攻击。
“嘛那~”
走路草被宝石海星的水枪放倒了，慌慌张张的想要站起来。
明明草系对水系有很高的抗性，结果宝石海星的水枪竟然打得走路草毫无反抗之力，最后更是被一个冲击直接放倒。
“去吧，神奇宝贝球！”
“达奈！”
突然间，草丛中蹿出了另一只神奇宝贝，是一只妙蛙种子！
它只是一道藤鞭就精准的将小霞的宝贝球抽飞。
先给宝石海星吃了几发藤鞭，紧接着一个撞击，宝石海星就失去了战斗能力。
看这伤害，就知道这只妙蛙种子有着不俗的战斗力。
“达~奈~”
妙蛙种子的前肢不安分的刨着地面，随时准备撞击的趋势。
看这架势，只要一言不合就开打。
‘妙蛙种子来了’
他的出现瞬间引起了想要扔球的举动，直接将它收服，然后带走。
不过仔细想了想，他还是放弃了自己此番举动。
这只妙蛙种子在神奇宝贝乡还有着自己的责任，自己强行把他带走，无疑会伤害两人之间的感情。
还是跟原剧情一样，自己悄悄地跟上去，培养一些感情后再将他带走。
自己身为训练家，就应该给每一只神奇宝贝都应有的尊重。
理清了其中的思路，小智散发出自己的波导，让妙蛙种子冷静下来。
“刚才小霞是想要收服走路草，并没有要欺负它，你不用抱有太大敌意。”
小智拿出了包里草系神奇宝贝爱吃的能量方块，轻轻地走到它面前。
蹲下身子，一点点用手推了过去，
“这个算作赔礼。”
皮卡皮卡~
一时之间，妙蛙种子也没有轻举妄动，它能感觉得出来，这个黄皮耗子有些不好惹。
强迫自己冷静下来，牢牢盯着他们两个，才拿出一颗能量方块嗅嗅，感觉没有问题后浅尝一下。
“达那~”
妙蛙种子的眼睛冒出亮光，再多尝了几口之后就没有继续吃下去。
而是用自己灵活的用藤鞭将食物卷了回去，将剩下的能量方块都推给了走路草。
“嘛那！”
吃下能量方块的走路草重新恢复了点精神，蹦蹦跳跳的钻入了草丛不见踪影。
妙蛙种子一边放出藤鞭警戒，一边倒退着，最后也消失在了草丛当中。
“小智哥哥，刚刚那是妙蛙种子耶，你不捕捉吗？”
在野外能够遇到野生的御三家，这可非常罕见，她也知道御三家的珍贵，可是要交好多钱才能获得的。
“我对这只妙蛙种子很感兴趣，但他似乎有职责在身。”小智一边向草丛当中走一边解释道，
“相信你们也看出来吧，刚刚那只早走路草太弱了，如果不是有妙蛙种子的保护，刚刚就被小霞收服了。”
“我很好奇这其中的隐情，想要知道这其中有什么原因指得妙，蛙种子尽心尽力的保护。”
“真不愧是小智啊。”小霞叹道，“就是可惜了，我的走路草。”
“走吧。”
小智带着两人一阵拐弯，利用波导紧紧的跟在妙蛙种子之后，向着神奇宝贝乡走去，寻找神奇宝贝疗养院。
一路上经过了妙蛙种子布置的一大堆陷阱，不过这一切都逃不过小智波导之力的感知。
小智成功带着众人度过这些危险的陷阱，来到了那个神秘的神奇宝贝疗养院。
“你们是…”
出现在小智面前的是疗养院的主人——小翠，也是一个成熟