徐阶抬头瞅了一眼朱翊钧，然后就叩首道：“罪员请陛下做事皆遵循内心！”
“对于一件事，不是问当不当做，而是问想不想做。”
“陛下甚至可以，选择做这一切的出发点，只是为一己之私欲，而将太师张文正公教给陛下的那些，要彷效历代圣主明君治国安邦的宏大理想，先放在一边，只问，做的事用的人，有没有让自己心里舒坦。”
“否则，太师张文正公教给陛下的那些强国富民之道，皆不过是空中楼阁。”
“陛下会很容易因此懈怠，即便陛下自己不懈怠，也难以保证后人不懈怠。”
朱翊钧听后，点首：“你没说错！”
接着，朱翊钧就站起身来，看着徐阶：“所以，朕决定还是赐你死罪，尽管你在竭力地向朕表现你的价值，让朕看见你徐阶比朕先生更厉害的地方，也在国子监配合的很好。”
徐阶一怔，脸上尽是诧异之色。
接着，徐阶就追问道：“既如此，罪员想问，对外扩张真的能让陛下和满朝权贵官僚更和睦吗？！”
说着，徐阶就又道：“另外，陛下，海外除了倭国那里有大量银子可以赚来兼并国内之地压榨本国生民外，真有那么多需要陛下依旧要杀罪员而不用罪员，而要去开拓的财货之利吗？”
朱翊钧点头：“有的。”
“不可能！”
“这绝对不可能！”
“陛下，之前罪员等是不想让朝廷与民夺利，所以才未让天子知道倭国多产银，甚至也故意鼓吹海洋凶险，不让朝廷和内地权贵官绅知道海利之丰厚。”
“但现在罪员自然不敢隐瞒，何况陛下也知道了海利之丰厚，事实证明海上凶险也不大。”
“可罪员实话告诉陛下，事实上，天下海利也就倭国有利可图而已，其次，南洋的话，不过是吕宋有银可赚，除此之外就是爪哇、满喇加。”
“但再南去就是汪洋大海，没有大陆。”
“东边除了倭国几处大岛外，也是汪洋大海！”
“而西边，早被西夷瓜分，且据西夷而言皆为蛮荒，无可垦之地。”
“北边就是大漠雪原，贫瘠得北虏不得不屡次南下寇掠。”
“所以，外面的海利并不足以支撑陛下用与权贵官绅和睦相处的方式实现中兴。”
“何况，陛下欲真要中兴，需要的不只是银子，本质上还得需要更多土地来养更多的百姓，可海外真没有那么多可耕之地。”
徐阶激动地说了起来，且一脸不解。
朱翊钧则朝他笑道：“你到底还是知道的不够仔细，也或许是你接触到的西夷瞒了你，南洋之南不是汪洋大海，而交趾之西也不是蛮荒。当然，且不论对外取利的事，即便在国内兴利生财，朕也自有良法，非你一只知走私货物与兼并田地且放贷之地主官僚可知。”
徐阶不禁微微皱眉，一副不愿意相信的样子，也就只道：“陛下，可是太师还对您说了什么？”
朱翊钧倒也不在乎徐阶相不相信，也没回答徐阶的问题，只说道：“你没说错，朕需要和光同尘，但是法有不可宽者！”
“而朕不能宽仁的底线就是，任何人都不能出卖国家利益！包括皇亲国戚和耆老勋贵；故而，你徐华亭是得被处死的，谁让你真的涉及走私通倭，朕得给天下人一个交待，让他们知道，只要通夷就是最恶的罪。”
“你但凡像高拱和朕的先生那样，在当国时，就主持开海和扩大开海规模一样，也开海通商，乃至允许对倭通商，甚至把对倭的贸易之货物不设任何禁令，你也不会现在还要因为走私通倭的事被处死。可你因为不想让朝廷得利，没有选择这样去改制，如此，你只能承担你没有这样做的代价。”
虽然高拱当国时主持的开海给大明朝廷从沿海官绅那里争取来了只一两万两税银收入增加，但至少也是真的在为国谋利，保证福建海域的水师具备一定战斗力是没问题，也比徐阶这种连一两万两也不舍得为朝廷争取的要好。
徐阶听朱翊钧这么说后，抽泣起来：“罪员悔之晚矣！”
朱翊钧接下来不久后就让侍御司拟旨对徐阶的个人功过进行了一番客观性的描述。
处置徐阶的诏旨，先肯定其了功绩，再昭彰了他的罪责，然后说明了考虑其曾在世庙时有庇护忠良与拨乱反正之功绩还保障了先帝顺利即位功绩的基础上，决定饶其凌迟之极刑，而改为赐死，留其全尸。
至于为何没有饶恕徐阶死罪，也予以了特别说明，皆因为治国首在强国，罪恶也首在叛国，而更甚于谋大逆，故不能不处死，而儆效尤。
而徐阶之子徐蟠、徐琨、徐瑛也因为参与走私叛国，而被处以大辟之刑，只是看在徐阶曾有功于国的份上，开恩改凌迟为斩立决。
徐阶之孙徐有庆以其不知情，且念其祖父辅弼功而判充军流放东番。
徐阶之兄弟徐陟